RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277817.10

HERC4-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 4,371 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-201ENST00000277817 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 NEK11Q8NG66 645 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TIGD1Q96MW7 591 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PSMB7Q99436 277 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SLF1Q9BQI6 1058 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DESI2Q9BSY9 194 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CBLCQ9ULV8 474 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ARHGAP6O43182 974 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PRKAB2O43741 272 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MAST3O60307 1309 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ATP2C2O75185 946 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SFTPCP11686 197 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SDHAP31040 664 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CETN2P41208 172 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MAPK9P45984 424 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PPARDQ03181 441 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 RLFQ13129 1914 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PAK1Q13153 545 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ADAM15Q13444 863 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 AUHQ13825 339 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TRIM14Q14142 442 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DOCK1Q14185 1865 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SPARCL1Q14515 664 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MBTPS1Q14703 1052 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TRIM60Q495X7 471 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CDH24Q86UP0 819 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CNBD1Q8NA66 436 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 HTRA1Q92743 480 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 C18orf8Q96DM3 657 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MRGPRX2Q96LB1 330 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TWNKQ96RR1 684 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TBC1D7Q9P0N9 293 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 RCOR1Q9UKL0 485 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SCN9AQ15858 1988 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CNTNAP1P78357 1384 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SNAP23O00161 211 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 FFAR2O15552 330 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GOLGA8HP0CJ92 632 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ALDH9A1P49189 494 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PLAURQ03405 335 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 NNTQ13423 1086 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 LRP8Q14114 963 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ERV3-1Q14264 604 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SLC39A14Q15043 492 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DCAF15Q66K64 600 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 RNF169Q8NCN4 708 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 FLAD1Q8NFF5 587 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 NELFBQ8WX92 580 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TBC1D5Q92609 795 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 MS4A5Q9H3V2 200 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CAMTA2O94983 1202 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 COL6A2P12110 1019 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CHRNDQ07001 517 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 PPP2R5BQ15173 497 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 LLGL1Q15334 1064 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 ANO4Q32M45 955 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 HDXQ7Z353 690 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC4-201ENST00000277817 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms