RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 TRPC3Q13507 836 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 PTK6Q13882 451 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 STXBP2Q15833 593 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 CCDC142Q17RM4 750 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 LIN9Q5TKA1 542 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ACTL9Q8TC94 416 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 GPRASP2Q96D09 838 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 SDCBP2Q9H190 292 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ELP3Q9H9T3 547 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 H0Y3Z8 333 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ASAP2O43150 1006 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 MYBL1P10243 752 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ITIH2P19823 946 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 MYO1EQ12965 1108 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 SNCBQ16143 134 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS1-201ENST00000262460 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 VTNP04004 478 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 GARTP22102 1010 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 CA4P22748 312 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 KLRC2P26717 231 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 NCALDP61601 193 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 IRX4P78413 519 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 VGLL4Q14135 290 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 ERICH1Q86X53 443 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 NOD2Q9HC29 1040 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 GINM1Q9NU53 330 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 WHRNQ9P202 907 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 PARP2Q9UGN5 583 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 HAO1Q9UJM8 370 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 HES2Q9Y543 173 aa9.14□□□□□ -0.95
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GINS1-201ENST00000262460 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 HSPA6P17066 643 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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GINS1-201ENST00000262460 ZNF699Q32M78 642 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 GNPTABQ3T906 1256 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 SPATA21Q7Z572 469 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 SGSM3Q96HU1 749 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.14□□□□□ -0.95
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GINS1-201ENST00000262460 A6NNZ2 444 aa9.14□□□□□ -0.95
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GINS1-201ENST00000262460 ITGB3P05106 788 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 KRT4P19013 534 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 TAC1P20366 129 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 MMP8P22894 467 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 ADRA1DP25100 572 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 ARL2P36404 184 aa9.14□□□□□ -0.95
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GINS1-201ENST00000262460 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 AGAP11Q8TF27 550 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS1-201ENST00000262460 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
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