RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ADH1AP07327 375 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 KLRC2P26717 231 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MFAP3P55082 362 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM14Q14142 442 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 DPH6Q7L8W6 267 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MMS19Q96T76 1030 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 ARID3AQ99856 593 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 IGFLR1Q9H665 355 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 FNIP2Q9P278 1114 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MTRRQ9UBK8 725 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PQJ5 194 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CYP11A1P05108 521 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 DUSP6Q16828 381 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 WSCD1Q658N2 575 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 UBR7Q8N806 425 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SDCBP2Q9H190 292 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 L1RE1Q9UN81 338 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TEX28O15482 410 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 FAM163BP0C2L3 166 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFV1P49821 464 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 HYAL1Q12794 435 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 BAP1Q92560 729 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 STK33Q9BYT3 514 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TACC1O75410 805 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 WEE2P0C1S8 567 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 RAP1GAPP47736 663 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CDH8P55286 799 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 JAM2P57087 298 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 GPR88Q9GZN0 384 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 NCK2O43639 380 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 OAZ2O95190 189 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CASP14P31944 242 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA18Q8TC71 538 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SHC3Q92529 594 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CISHQ9NSE2 258 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 MYO6Q9UM54 1294 aa20.78■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 PLXNA3P51805 1871 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 F8VZ95 297 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 GLUD1P00367 558 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 OR1D2P34982 312 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 ARPP19P56211 112 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 INCA1Q0VD86 236 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 TTC39CQ8N584 583 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 EFHBQ8N7U6 833 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 SPAG5Q96R06 1193 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HOXD11-201ENST00000249504 OR6C75A6NL08 312 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD11-201ENST00000249504 TPM1P09493 284 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD11-201ENST00000249504 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD11-201ENST00000249504 CPB1P15086 417 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD11-201ENST00000249504 CD58P19256 250 aa20.76■□□□□ 0.91
HOXD11-201ENST00000249504 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HOXD11-201ENST00000249504 LHX1P48742 406 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms