RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041730.10

Lmx1b-201, Transcript of LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmx1b, Length 4,790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Grk2Q99MK8 689 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rnf135Q9CWS1 417 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Sv2aQ9JIS5 742 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Erbb2P70424 1256 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Togaram2Q3TYG6 1002 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Agxt2Q3UEG6 513 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zc4h2Q68FG0 224 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Btbd10Q80X66 475 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Arhgap15Q811M1 481 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dnali1Q8BVN8 258 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Vps39Q8R5L3 886 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gnl1P36916 607 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cd180Q62192 661 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dclk2Q6PGN3 756 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 ClmnQ8C5W0 1052 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Btbd9Q8C726 612 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Emc2Q9CRD2 297 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Batf3Q9D275 118 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Abcb11Q9QY30 1321 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Znf804aA2AKY4 1200 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm16430A6X8J1 155 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PtproE9Q612 1226 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Usp17lbE9Q9U0 468 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Stam2O88811 523 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PrkceP16054 737 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PrkcbP68404 671 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 ZufspQ3T9Z9 577 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Psen2Q61144 448 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Soat1Q61263 540 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Klra3Q64329 266 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 LdhdQ7TNG8 484 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tmc3Q7TQ69 1130 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dcaf8Q8N7N5 591 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Kif19Q99PT9 997 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Slxl1Q9D515 155 aa14.61□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Arfgef2A2A5R2 1792 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Lilrb3P97484 841 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mks1Q5SW45 561 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Lig4Q8BTF7 911 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PudpQ9D5U5 234 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Atp8b4A2ANX3 1194 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 E2f6O54917 272 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ccnd1P25322 295 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Msr1P30204 458 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PolgP54099 1218 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 CstaP56567 97 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Chrna5Q2MKA5 467 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Nudt16Q6P3D0 195 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Palm2Q8BR92 376 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tfr2Q9JKX3 798 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Trpc4Q9QUQ5 974 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Scgb2b21A0A087WQA9 112 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pcdh9F8VPK8 1237 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ptpn12P35831 775 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Siah1aP61092 282 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm4981Q3ULJ8 291 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dusp4Q8BFV3 398 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Asb11Q9CQ31 323 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Dpp7Q9ET22 506 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zscan4dA7KBS4 506 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Slfn8B1ARD8 910 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 ItgalP24063 1163 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Hoxc10P31257 342 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Samd11Q1RNF8 542 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 SpoplQ2M2N2 392 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Arid5aQ3U108 590 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Muc3aQ3U5A2 218 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zscan4fQ3URS2 506 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 P2rx5Q3UYI1 455 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Afap1l2Q5DTU0 825 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zscan4cQ80VJ6 506 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Baiap2l2Q80Y61 522 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Best2Q8BGM5 508 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 TxlngQ8BHN1 524 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 LzicQ8K3C3 190 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tesk2Q8VCT9 570 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Txndc9Q9CQ79 226 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Q9CR55 154 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 March8Q9DBD2 286 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mettl1Q9Z120 268 aa14.6□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Hoxb8P09632 243 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gdpd4Q3TT99 632 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rbl2Q64700 1135 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Sarm1Q6PDS3 724 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ric8bQ80XE1 520 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Strip2Q8C9H6 844 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gprc5cQ8K3J9 440 aa14.59□□□□□ -0.07
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Lpin2Q99PI5 893 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.2 ms