RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W GPX2P38143 162 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W AVT5P38176 459 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ATG22P25568 528 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W AGA1P32323 725 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YIL152WP40455 235 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YPR127WQ06494 345 aa2.26□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W Q0255P03881 472 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MED8P38304 223 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W AIM2P39721 246 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SPC24Q04477 213 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PEX30Q06169 523 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W COQ10Q08058 207 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YPL257WQ08974 193 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W CPT1P17898 393 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W TOA2P32774 122 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ETR1P38071 380 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MIX23P38162 196 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YPC1P38298 316 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W POP4P38336 279 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RRT13P40042 185 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SLM1P40485 686 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YGR201CP42936 225 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RRT5P43607 289 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YFR057WP43625 151 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W VHT1P53241 593 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RNH201P53942 307 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YGR018CP53211 109 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W COG5P53951 403 aa2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ERG2P32352 222 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MRPL28P36527 147 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W GLE2P40066 365 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MRX11Q03079 207 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W CDC28P00546 298 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MRS4P23500 304 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YCR101CP25607 182 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SKG1P36169 355 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W CDH1P53197 566 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W HHT1P61830 136 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YDR278CQ05612 105 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YOL019WQ08157 551 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MCT1Q12283 360 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ATP14Q12349 124 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W AGC1Q12482 902 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MHT1Q12525 324 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W APS1P35181 156 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W POP8P38208 133 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PHO89P38361 574 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MDM31P38880 579 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W BDH1P39714 382 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W FMP32P43557 207 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W TOS2P50078 622 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MRX4Q12467 430 aa2.24□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W TPI1P00942 248 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W IMP1P28627 190 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YBR063CP38083 404 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YCH1P42937 148 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W OST3P48439 350 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W BOR1P53838 576 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W LPP1Q04396 274 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SML1Q04964 104 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YLR112WQ12130 139 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W JID1Q12350 301 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W SIR2P06700 562 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W FCY2P17064 533 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PEX22P39718 180 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PHO23P50947 330 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W DID2P69771 204 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W OAC1P32332 324 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W NTF2P33331 125 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W IRC24P40580 263 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W DIM1P41819 318 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W LCB3P47013 409 aa2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ERI1P62651 68 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ADH3P07246 375 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W MDM10P18409 493 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W UPS1Q05776 175 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W RDI1Q12434 202 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W CYC3P06182 269 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W HOT13P36078 116 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YER076CP40049 302 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W HHO1P53551 258 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W CPR1P14832 162 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W PRM8P53174 237 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W UBC7Q02159 165 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W DYN2Q02647 92 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W YPL247CQ12523 523 aa2.22□□□□□ -2.05
SIN3YOL004W ATG40Q99325 256 aa2.22□□□□□ -2.05
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