RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YKL075C	P36083	450 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YBL071C	P38185	102 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MIC12	P38341	106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	PEX7	P39108	375 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	BDH1	P39714	382 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	CAF16	P43569	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	UBC12	P52491	188 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	JAC1	P53193	184 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YAP1802	P53309	568 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YNR066C	P53752	436 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	HOR7	Q05827	59 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	QCR9	P22289	66 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YCR022C	P25620	114 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	POP5	P28005	173 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YBR292C	P38357	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	SAS2	P40963	338 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	NDE2	Q07500	545 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MSN1	P22148	382 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YPS1	P32329	569 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	CDS1	P38221	457 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	SPC25	P40014	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YJR015W	P47090	510 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	MIC27	P50945	234 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	PHO23	P50947	330 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YHP1	Q04116	353 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	COA4	Q05809	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	TDA6	Q06466	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	RXT3	Q07458	294 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	POM34	Q12445	299 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	FMP16	Q12497	93 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CIN4	YMR138W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CYC3	P06182	269 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ACP1	P32463	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YBL059W	P34224	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	RRT1	P38192	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	RPA43	P46669	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	IMP2	P46972	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	POS5	Q06892	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	IRC23	Q08416	157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	TIM18	Q08749	192 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	PRM3	Q08931	133 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	COX19	Q3E731	98 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	UTR5	P32630	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	AVT5	P38176	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SHG1	P38337	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	GLE2	P40066	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	EMC5	P40540	141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YDL186W	P48568	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	LST7	P53237	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	HST4	P53688	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CAF40	P53829	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	AVO2	Q04749	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ATP14	Q12349	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CDC50	P25656	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ICS2	P38284	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	VMA7	P39111	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	TOS8	P53147	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CPD1	P53314	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CAB4	P53332	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ODC1	Q03028	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SDH7	Q04401	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SHH3	Q04487	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ARR3	Q06598	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	CDC7	P06243	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ZRC1	P20107	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	POR2	P40478	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SYG1	P40528	902 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	AGE2	P40529	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	RTS2	P40962	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	OCA2	P53949	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	TMA23	Q03525	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	ERS1	P17261	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	SPO13	P23624	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	DER1	P38307	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	FLO5	P38894	1075 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	PET100	P38958	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIN4	YMR138W	YPI1	P43587	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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