RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YKL075C	P36083	450 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	SRB7	P47822	140 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.87	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	CCW14	O13547	238 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	ERV1	P27882	189 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	ACP1	P32463	125 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	PDC2	P32896	925 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	UIP3	P39547	235 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	RFC2	P40348	353 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	PKP2	P53170	491 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	DID2	P69771	204 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	FSH2	Q05015	223 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		5.86	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	STF2	P16965	84 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	SLM6	P38343	150 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	RAD28	Q12021	506 aa		5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	GEP4	P38812	185 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	FEX2	Q08991	375 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	PPT2	Q12036	173 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YPS3	Q12303	508 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PAM17	YKR065C	YKL162C	P36052	402 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	PHD1	P36093	366 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	CUE1	P38428	203 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YEA6	P39953	335 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ERG25	P53045	309 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YGR050C	P53231	118 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	PDR17	P53844	350 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	PLP1	Q04004	230 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ANT1	Q06497	328 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	FEX1	Q08913	375 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	RAX2	Q12465	1220 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YLR302C	O13544	120 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	SEC22	P22214	214 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	PSD1	P39006	500 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	RRT7	Q07829	113 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YPL264C	Q08980	353 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	JID1	Q12350	301 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ATG5	Q12380	294 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	AGC1	Q12482	902 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	FPR2	P32472	135 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	ATO3	Q12359	275 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YEA4	P40004	342 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	SNX4	P47057	423 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	EST3	Q03096	181 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	DCS1	Q06151	350 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	AEP3	Q12089	606 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	SHG1	P38337	142 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	COX15	P40086	486 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	AGX1	P43567	385 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	TAD2	P47058	250 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	JAC1	P53193	184 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YMR166C	Q03829	368 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YMR082C	Q04276	118 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	SPG4	Q04438	115 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	PRY2	P36110	329 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YBR292C	P38357	123 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YJL213W	P40896	331 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	YNR066C	P53752	436 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	APJ1	P53940	528 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAM17	YKR065C	MRS3	P10566	314 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	VMA22	P38784	181 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	KRE9	P39005	276 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	HXT14	P42833	540 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	NDE2	Q07500	545 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	FCY1	Q12178	158 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	COA2	Q3E823	68 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAM17	YKR065C	FCY2	P17064	533 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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