RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	ATP10	P18496	279 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	POF1	P25576	258 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	POP5	P28005	173 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SDH4	P37298	181 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	QDR3	P38227	689 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YER121W	P40076	114 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PHS1	P40857	217 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	BNS1	P50084	137 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	MGA1	P53050	456 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DYN2	Q02647	92 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	USV1	Q12132	391 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	APA2	P22108	325 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YBL059W	P34224	193 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PAU15	P40585	124 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SED1	Q01589	338 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YMR007W	Q03675	126 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	CTR3	Q06686	241 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YPS3	Q12303	508 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ECM14	P38836	430 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PSD1	P39006	500 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DFG10	P40526	253 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YJR015W	P47090	510 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DAD3	P69850	94 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	API2	Q04413	109 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	AVO2	Q04749	426 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SOR2	Q07786	357 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RAD28	Q12021	506 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ERV2	Q12284	196 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	IRA2	P19158	3079 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	MRS3	P10566	314 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DAL80	P26343	269 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	COQ3	P27680	312 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DAL3	P32459	195 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	TCA17	P32613	152 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SPC29	P33419	253 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	DER1	P38307	211 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SDH8	P38345	138 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	CTR2	P38865	189 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	HSP10	P38910	106 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.41	□□□□□ -1.54	not detected
MIA40	YKL195W	YGL114W	P53134	725 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	BOR1	P53838	576 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	FYV6	P53913	173 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YNL046W	P53956	172 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	ATC1	Q04005	294 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	SHH3	Q04487	196 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	FRQ1	Q06389	190 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YLR118C	Q12354	227 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	POM34	Q12445	299 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	HMX1	P32339	317 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YBR013C	P38215	129 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	MIC27	P50945	234 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	CGR1	P53188	120 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	CRH1	P53301	507 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	IRC25	Q07951	179 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YDL009C	Q12210	107 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	YOR029W	Q12243	111 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	RAX2	Q12465	1220 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MIA40	YKL195W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YFL015C	P43578	164 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YJL118W	P47022	219 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	TAX4	P47030	604 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YNR064C	P53750	290 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	ARL3	Q02804	198 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	LOA1	Q06508	300 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	POS5	Q06892	414 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	IRA1	P18963	3092 aa		5.39	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.38	□□□□□ -1.55	not detected
MIA40	YKL195W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	SPS18	P32572	300 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	HIT1	P46973	164 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	LDS2	Q08218	356 aa		5.38	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
MIA40	YKL195W	CDS1	P38221	457 aa		5.37	□□□□□ -1.55

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