RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W NAG1Q8TGN9 163 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W YPR117WQ06116 2489 aa3.28□□□□□ -1.88
HCA4YJL033W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W COX9P07255 59 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W QCR2P07257 368 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MDL1P33310 695 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YKL187CP34231 750 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W UMP1P38293 148 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SPG5P42933 373 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MTM1P53320 366 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RNH201P53942 307 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W DYN2Q02647 92 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W CTF19Q02732 369 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FSH2Q05015 223 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RLM1Q12224 676 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YOL162WP0CF19 215 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU16P35994 123 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SLM6P38343 150 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W HSP10P38910 106 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YEA4P40004 342 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TTI2P47168 421 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MRX8Q05473 314 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TAZ1Q06510 381 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PPT2Q12036 173 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FRE8Q12209 686 aa3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MXR2P25566 168 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TRR1P29509 319 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YKL102CP34249 101 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YUH1P35127 236 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YBR292CP38357 123 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W GGC1P38988 300 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
HCA4YJL033W YJR015WP47090 510 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TPC1P53257 314 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W BOR1P53838 576 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MRPL19P53875 158 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SYM1Q06563 197 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YDR262WQ12331 272 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YOS1Q3E834 85 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU1P0CE88 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU14P0CE89 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU6P0CE90 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU18P0CE91 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU8P0CE92 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU11P0CE93 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YGL010WP25338 174 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YCR007CP25354 239 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W OCH1P31755 480 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W UGX2P32772 223 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W DAD2P36162 133 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU13P38725 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.26□□□□□ -1.89not detected
HCA4YJL033W YER134CP40081 178 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YNL198CP40166 100 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PRM5P40476 318 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU4P53427 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PDR17P53844 350 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU10Q03050 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YMR166CQ03829 368 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W CAB5Q03941 241 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU20Q08322 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YDL009CQ12210 107 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PAU9Q3E770 120 aa3.26□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W CCH1P50077 2039 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FMP27Q06179 2628 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YKR104WP0CE69 306 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W URA5P13298 226 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PCL1P24867 279 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YOX1P34161 385 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YPS6P40583 537 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YJL028WP47062 111 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W BXI1P48558 297 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W COQ5P49017 307 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W APS2Q00381 147 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W TSA2Q04120 196 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W HRT1Q08273 121 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SCS22Q6Q595 175 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W SDS24P38314 527 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W PRE5P40302 234 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MOB1P40484 314 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W HIT1P46973 164 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W GPI14P47088 403 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W BRR6P53062 197 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W LST7P53237 242 aa3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W ALG9P53868 555 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
HCA4YJL033W YPL162CQ12042 273 aa3.25□□□□□ -1.89
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