RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640184.1

CASP1-217, Transcript of caspase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP1, Length 327 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1-217ENST00000640184 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 STK33Q9BYT3 514 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 FZD8Q9H461 694 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 HAUS4Q9H6D7 363 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MINDY3Q9H8M7 445 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SPC25Q9HBM1 224 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 RNF186Q9NXI6 227 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 AIPL1Q9NZN9 384 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MYO6Q9UM54 1294 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TFR2Q9UP52 801 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 GINS2Q9Y248 185 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 Q9Y3F1 56 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PTPRJQ12913 1337 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 UQCRHLA0A096LP55 91 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 HAS3O00219 553 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ZNF263O14978 683 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PMM2O15305 246 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SEPT4O43236 478 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TSPAN1O60635 241 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 KPNA6O60684 536 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TNFRSF21O75509 655 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 LCA5LO95447 670 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PGK1P00558 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 HLA-DRAP01903 254 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 HMGCRP04035 888 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 UQCRHP07919 91 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 IQCF3P0C7M6 154 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CCDC172P0C7W6 258 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MCF2P10911 925 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 FGFR4P22455 802 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PROZP22891 400 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ADH6P28332 368 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 HOXD10P28358 340 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 USP8P40818 1118 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PRKCIP41743 596 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ARHGAP25P42331 645 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MAGEA1P43355 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MFAP3P55082 362 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 GJA9P57773 515 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 HTRA3P83110 453 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CAP1Q01518 475 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PLAURQ03405 335 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 POU5F1BQ06416 359 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MCL1Q07820 350 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 KIF5AQ12840 1032 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SURF1Q15526 300 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SLC18A3Q16572 532 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 FAM187BQ17R55 369 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 KIZQ2M2Z5 673 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SYT9Q86SS6 491 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 VPS36Q86VN1 386 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 WDR49Q8IV35 697 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SLC35F6Q8N357 371 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CEP120Q8N960 986 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 LMO3Q8TAP4 145 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 RAET1EQ8TD07 263 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 TAS1R2Q8TE23 839 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 SEMA4DQ92854 862 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ELMO3Q96BJ8 720 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 OSMRQ99650 979 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 GPR88Q9GZN0 384 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 CDT1Q9H211 546 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 PDZD7Q9H5P4 517 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 IGFLR1Q9H665 355 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP1-217ENST00000640184 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.2 ms