RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 LLGL1Q15334 1064 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CDC73Q6P1J9 531 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ASIC4Q96FT7 647 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CNDP1Q96KN2 507 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 CASS4Q9NQ75 786 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 AREL1O15033 823 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GPR1P46091 355 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 GMFBP60983 142 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 POU5F1BQ06416 359 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 STX4Q12846 297 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SLC18A3Q16572 532 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 HECTD3Q5T447 861 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 SFR1Q86XK3 245 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQJ5 194 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA3DO95025 777 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EFHC2Q5JST6 749 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 LCORLQ8N3X6 602 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 FAM162AQ96A26 154 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ISCUQ9H1K1 167 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ADORA1P30542 326 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GNA15P30679 374 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 VAMP7P51809 220 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RFX8Q6ZV50 586 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BEST2Q8NFU1 509 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EMC3Q9P0I2 261 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GSAPA4D1B5 854 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM22K7EJ46 135 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 IDH3BO43837 385 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HMOX2P30519 316 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 OOSP2Q86WS3 158 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 STK33Q9BYT3 514 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF521Q96K83 1311 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TLR2O60603 784 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 IFNGR2P38484 337 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT3Q14435 633 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CCNG2Q16589 344 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 AMACRQ9UHK6 382 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 GDAQ9Y2T3 454 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN9O75954 239 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KCNA2P16389 499 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KCTD2Q14681 263 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00523Q86TU6 105 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC185Q8N715 623 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NINQ8N4C6 2090 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM120BA0PK00 339 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 OPLAHO14841 1288 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NCK2O43639 380 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM270Q6UE05 265 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 USP33Q8TEY7 942 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ADCY6O43306 1168 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 HUS1O60921 280 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RCVRNP35243 200 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRT-209ENST00000612229 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 NPR3P17342 541 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 SDC4P31431 198 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BCAR1P56945 870 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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