RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599454.5

PNKP-212, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-212ENST00000599454 GPBP1Q86WP2 473 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 MYCT1Q8N699 235 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 DSEQ9UL01 958 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ACACBO00763 2458 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 OBSL1O75147 1896 aa22.94■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 TRAK2O60296 914 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 CTHP32929 405 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 UBA7P41226 1012 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 PLCB2Q00722 1185 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 GAS6Q14393 721 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 RABEP1Q15276 862 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 GPR158Q5T848 1215 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 JADE1Q6IE81 842 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.93■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 PIRO00625 290 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 PPEF2O14830 753 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 GABRR2P28476 465 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SMARCB1Q12824 385 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 VEPH1Q14D04 833 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 LONP2Q86WA8 852 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 FAM212AQ96EL1 285 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ASB7Q9H672 318 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 TASP1Q9H6P5 420 aa22.92■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ANO9A1A5B4 782 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 BMP15O95972 392 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 CDC25CP30307 473 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 GTF2BQ00403 316 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SPEM2Q0P670 501 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 LPAL2Q16609 132 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 METTL23Q86XA0 190 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 GCNAQ96QF7 691 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 TMEM209Q96SK2 561 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 C2CD2Q9Y426 696 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.91■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 NFICP08651 508 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 HOXA6P31267 233 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SOX9P48436 509 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 NETO1Q8TDF5 533 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PNKP-212ENST00000599454 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 K7ESF4 209 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 GJB2P29033 226 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 FNTBP49356 437 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 TAF6P49848 677 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 PTPAQ15257 358 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 RAD54LQ92698 747 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 FIZ1Q96SL8 496 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.89■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 HRO43593 1189 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 SOAT2O75908 522 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 PLCG1P19174 1290 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 MCM2P49736 904 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 CCINQ13939 588 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 TMX3Q96JJ7 454 aa22.88■■□□□ 1.25
PNKP-212ENST00000599454 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms