RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 ADCY1Q08828 1119 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 UVSSAQ2YD98 709 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LIN9Q5TKA1 542 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR149Q86SP6 731 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SUSD6Q92537 303 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 POMKQ9H5K3 350 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP4F11Q9HBI6 524 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CD320Q9NPF0 282 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DSEQ9UL01 958 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 L1RE1Q9UN81 338 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TSC2P49815 1807 aa7.31□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 BICDL2A1A5D9 508 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 OR6C75A6NL08 312 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HCRTO43612 131 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP2C2O75185 946 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 VNN1O95497 513 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LRG1P02750 347 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ATF2P15336 505 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPN2P17706 415 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LMO2P25791 158 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CDH8P55286 799 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CLDN10P78369 228 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NTHL1P78549 312 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC63Q05C16 580 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP3CAQ08209 521 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP4Q13115 394 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR17Q13304 367 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NCOA4Q13772 614 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TPGS2Q68CL5 300 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SV2AQ7L0J3 742 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 DPH6Q7L8W6 267 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 OSTM1Q86WC4 334 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PI4K2AQ9BTU6 479 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.3□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRN2O75325 713 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 VNN2O95498 520 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-DRAP01903 254 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ATICP31939 592 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3CAP42336 1068 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH1A3P47895 512 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 LHX1P48742 406 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP12P59046 1061 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNC1P63316 161 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MYL7Q01449 175 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPY1Q01534 308 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 PAK1Q13153 545 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF699Q32M78 642 aa7.29□□□□□ -1.24
EFTUD2-211ENST00000588374 ZACNQ401N2 412 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms