RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 FAM212AQ96EL1 285 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 XYLT2Q9H1B5 865 aa23.64■■□□□ 1.38
SPNS1-207ENST00000565975 ASAP2O43150 1006 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 FSBPO95073 299 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 GJB6O95452 261 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 KLRC2P26717 231 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TRIM50Q86XT4 487 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 OTUD5Q96G74 571 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CEP83Q9Y592 693 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ADM5C9JUS6 153 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 HBP1O60381 514 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TJP3O95049 919 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 IL18RAPO95256 599 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ASPAP45381 313 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 SPATA33Q96N06 139 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 KRT1P04264 644 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 GJC1P36383 396 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 SLCO1A2P46721 670 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 IFT88Q13099 833 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 KCTD2Q14681 263 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 IZUMO3Q5VZ72 239 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 DLK2Q6UY11 383 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ERICH1Q86X53 443 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 MCEEQ96PE7 176 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 LIASO43766 372 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ACSL3O95573 720 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 PGK2P07205 417 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 MMP19Q99542 508 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 LHX5Q9H2C1 402 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 PPARDQ03181 441 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 PPIL2Q13356 520 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 LONRF1Q17RB8 773 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TFAP2BQ92481 460 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 P3H4Q92791 437 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CABS1Q96KC9 395 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 MED7O43513 233 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 WEE2P0C1S8 567 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 OGDHQ02218 1023 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 POU5F1BQ06416 359 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CNGA2Q16280 664 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 POLNQ7Z5Q5 900 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 PACS2Q86VP3 889 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 NLRP4Q96MN2 994 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 CDT1Q9H211 546 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 MROH8Q9H579 483 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 NDC80O14777 642 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 OSBPP22059 807 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 NF2P35240 595 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 VPS41P49754 854 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 KYNUQ16719 465 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF394Q53GI3 561 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-207ENST00000565975 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms