RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ATP8B2P98198 1209 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TRIM14Q14142 442 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SESTD1Q86VW0 696 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZNF480Q8WV37 535 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TMX3Q96JJ7 454 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 UIMC1Q96RL1 719 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 A0A087WV62 115 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 POM121BA6NF01 834 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ADAMTS3O15072 1205 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TRIM24O15164 1050 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 THP07101 528 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 NPR1P16066 1061 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SMARCA1P28370 1054 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PRDX5P30044 214 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GUCY1A2P33402 732 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 RENBPP51606 427 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ELF2Q15723 593 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ALFQ53S48 1182 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CCDC174Q6PII3 467 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CCT6BQ92526 530 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PDCD2LQ9BRP1 358 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CDC23Q9UJX2 597 aa6.31□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GYPEP15421 78 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 LAG3P18627 525 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 DDCP20711 480 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CHKAP35790 457 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TECP42680 631 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ARFIP2P53365 341 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CTXN1P60606 82 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 BIRC3Q13489 604 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PAF1Q8N7H5 531 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 RAB24Q969Q5 203 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 DPH1Q9BZG8 443 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 EPC1Q9H2F5 836 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TOR3AQ9H497 397 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 LANCL2Q9NS86 450 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ING3Q9NXR8 418 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CPA4Q9UI42 421 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 COL4A3Q01955 1670 aa6.3□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PPC4 97 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZAR1LA6NP61 321 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 NRP1O14786 923 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ADCY6O43306 1168 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ALDH1A2O94788 518 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 HSD3B1P14060 373 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 BRAFP15056 766 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ICA1Q05084 483 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MTM1Q13496 603 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 EMC10Q5UCC4 262 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.29□□□□□ -1.4
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