RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 SUN2Q9UH99 717 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SYT15Q9BQS2 421 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CIPCQ9C0C6 399 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 CTSEP14091 401 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CCL23P55773 120 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC188H7C350 402 aa8.46□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 RNF40O75150 1001 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRB-209ENST00000550857 CDO1Q16878 200 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 GIPC2Q8TF65 315 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRB-209ENST00000550857 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.46□□□□□ -1.06
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