RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC43Q8N309 656 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CXCL11O14625 94 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TOMM70O94826 608 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 F9P00740 461 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MYL2P10916 166 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 OAZ1P54368 228 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TWF1Q12792 350 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PTPAQ15257 358 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 YME1L1Q96TA2 773 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RRN3Q9NYV6 651 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ANGPT2O15123 496 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO21O94952 628 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 EPHB3P54753 998 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 INHBEP58166 350 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 OCA2Q04671 838 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 Q4G0T1 1027 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf89Q6UX73 402 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TADA1Q96BN2 335 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CPVLQ9H3G5 476 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ABCB6Q9NP58 842 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 STOML1Q9UBI4 398 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DYRK3O43781 588 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NPTXRO95502 500 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 UCHL3P15374 230 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GUCY2CP25092 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AXLP30530 894 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 THPOP40225 353 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA18Q8TC71 538 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ABHD8Q96I13 439 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 MYO9BQ13459 2157 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1B0GTH6 734 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 THP07101 528 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NCAM1P13591 858 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GCKP35557 465 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TP53BP2Q13625 1128 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PDK2Q15119 407 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RUBCNLQ9H714 662 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 GID8Q9NWU2 228 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ATP9BO43861 1147 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 UPP2O95045 317 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KRT8P05787 483 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PDGFRBP09619 1106 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 DPEP1P16444 411 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KRT4P19013 534 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 PAX3P23760 479 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BCAT1P54687 386 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 TAGAPQ8N103 731 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 COG1Q8WTW3 980 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-226ENST00000546160 NAT9Q9BTE0 207 aa6.68□□□□□ -1.34
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