RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	BRF1	Q92994	677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	LCT	P09848	1927 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FSCN2	O14926	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MGEA5	O60502	916 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CD4	P01730	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ALAS1	P13196	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MYOG	P15173	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	GNAT2	P19087	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC16A2	P36021	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ETV3	P41162	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SLC1A4	P43007	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	STAT2	P52630	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RABGGTB	P53611	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	OAZ1	P54368	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CCL23	P55773	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NUCB2	P80303	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PPARA	Q07869	468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ODF1	Q14990	250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CRY1	Q16526	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	NAPB	Q9H115	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SBF2-208	ENST00000528478	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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