RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 CEBPBP17676 345 aa28.73■■■□□ 2.19
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RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.71■■■□□ 2.19
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RPS6KA1-212ENST00000526040 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa28.67■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
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RPS6KA1-212ENST00000526040 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRR29P0C7W0 189 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPY1Q01534 308 aa28.66■■■□□ 2.18
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