RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAN1Q9Y2M0 1017 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 EML5Q05BV3 1969 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR19Q8NEZ3 1342 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PI4KAP42356 2102 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCA7Q8IZY2 2146 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PMS2P1A4D2B8 440 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKUB1A6NFN9 424 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRN3P2A6NIE6 340 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 HEPACAM2A8MVW5 462 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 K7EM74 188 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFS2O75306 463 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFSF15O95150 251 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DLGAP3O95886 979 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTLL1O95922 423 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 F11P03951 625 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 GALTP07902 379 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOP08100 348 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TGFB3P10600 412 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DRD1P21728 446 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP2R1AP30153 589 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK8P49336 464 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLCB2Q00722 1185 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SP4Q02446 784 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOLH1Q04609 750 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEDD9Q14511 834 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC96Q2M329 555 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNPTABQ3T906 1256 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOMO2Q5JPE7 1267 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLLU1OSQ5K130 101 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR45BQ5MNZ6 344 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYDE2Q5VT97 1194 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP135Q66GS9 1140 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 IQCEQ6IPM2 695 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAPN12Q6ZSI9 719 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCTD1Q719H9 257 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAREM2Q75VX8 874 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 C14orf80Q86SX3 495 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM50Q86XT4 487 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ECHDC2Q86YB7 292 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP97Q8IW35 865 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NME8Q8N427 588 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARL14Q8N4G2 192 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMER3Q8N944 861 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RDH13Q8NBN7 331 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIMC1Q8NDZ2 872 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC7A14Q8TBB6 771 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM212AQ96EL1 285 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFYVE19Q96K21 471 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCLT1Q96NL6 688 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTMR9Q96QG7 549 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 P2RY13Q9BPV8 354 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRTM1Q9HBL6 345 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF287Q9HBT7 754 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF19AQ9NV58 838 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DACT1Q9NYF0 836 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PARP2Q9UGN5 583 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTMR7Q9Y216 660 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FHOD1Q9Y613 1164 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFASCO94856 1347 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIVEP2P31629 2446 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GVT2 93 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 E2F8A0AVK6 867 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR27A2RRH5 827 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESPNB1AK53 854 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0R2C6 588 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 LAD1O00515 517 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 FANCGO15287 622 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPAN3O60637 253 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLA2G6O60733 806 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DGAT1O75907 488 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJB5O75953 348 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNTN5O94779 1100 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 STBD1O95210 358 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 CBX6O95503 412 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-548P-201ENST00000517083 THEGLP0DJG4 465 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms