RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 DENND3A2RUS2 1198 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP1O94782 785 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PROSCO94903 275 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 RFX1P22670 979 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 MARK3P27448 753 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPTX2P47972 431 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPC3P51654 580 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLCB3Q01970 1234 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC142Q17RM4 750 aa7.22□□□□□ -1.25
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RAPGEF6-211ENST00000512611 HHATQ5VTY9 493 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 HHIPL2Q6UWX4 724 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 OGFOD1Q8N543 542 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC89Q8N998 374 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 MORC4Q8TE76 937 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERAC1Q96JX3 654 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NT5C1BQ96P26 610 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.22□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
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RAPGEF6-211ENST00000512611 SP4Q02446 784 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLC1Q07866 573 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM270Q6UE05 265 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 MZB1Q8WU39 189 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 INPP5DQ92835 1189 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM206Q9H813 350 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.21□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLRN2A0PK11 232 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNE2O96020 404 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 FESP07332 822 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD48P09326 243 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPATA31D3P0C874 917 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 BGNP21810 368 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.21□□□□□ -1.26
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RAPGEF6-211ENST00000512611 IFT43Q96FT9 208 aa7.21□□□□□ -1.26
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RAPGEF6-211ENST00000512611 CSRNP1Q96S65 589 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRD1A4D1F6 860 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 G3V3G9 751 aa7.21□□□□□ -1.26
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RAPGEF6-211ENST00000512611 ETS2P15036 469 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMC5P62195 406 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTP4A2Q12974 167 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAF5Q15542 800 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LDHDQ86WU2 507 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CPXCR1Q8N123 301 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.21□□□□□ -1.26
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RAPGEF6-211ENST00000512611 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.21□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE4BO95155 1302 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SGK1O00141 431 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 C2CD2LO14523 706 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYB561D2O14569 222 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 P4HA2O15460 535 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCTN3O75935 186 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 VNN1O95497 513 aa7.2□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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