RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSE	Q9UL01	958 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MICAL2	O94851	1124 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFH	P08603	1231 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYK	P43405	635 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP2J2	P51589	502 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCAN	O14594	1321 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	HCRT	O43612	131 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PI15	O43692	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GJA1	P17302	382 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATF6	P18850	670 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNPLA4	P41247	253 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPC5	P78333	572 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBP5	P82980	135 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	NHLH1	Q02575	133 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPYD	Q12882	1025 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	BFSP1	Q12934	665 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMD6	Q15008	389 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIX5	Q8N196	739 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABRD	O14764	452 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYL1	P05976	194 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLCN5	P51795	746 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SURF1	Q15526	300 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAREM2	Q75VX8	874 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL4A2	P08572	1712 aa		13.67	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms