RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 KXD1Q9BQD3 176 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 ASAH2Q9NR71 780 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 CA14Q9ULX7 337 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.91■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 CMA1P23946 247 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 ALDH1A3P47895 512 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 EPHB3P54753 998 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 STARD6P59095 220 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 CUL4BQ13620 913 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 TMC8Q8IU68 726 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 INTS13Q9NVM9 706 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 SIX4Q9UIU6 781 aa20.9■□□□□ 0.94
USP40-217ENST00000496298 AFMP43652 599 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 RBP5P82980 135 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PFKPQ01813 784 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ASB16Q96NS5 453 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 GPR88Q9GZN0 384 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 HPSEQ9Y251 543 aa20.89■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PTPRJQ12913 1337 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 KLRC4O43908 158 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 MYL4P12829 197 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 MRE11P49959 708 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SPATA18Q8TC71 538 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PSMG2Q969U7 264 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PAGE5Q96GU1 130 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SHDQ96IW2 340 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 FAM84AQ96KN4 292 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PHOX2BQ99453 314 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 USP25Q9UHP3 1055 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 L1RE1Q9UN81 338 aa20.88■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 H0Y858 1186 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 KRT85P78386 507 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PRKCQQ04759 706 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SMARCD2Q92925 531 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SPATA32Q96LK8 384 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ACBD6Q9BR61 282 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.87■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 A0A1B0GVL5 298 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 HUS1O60921 280 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PFKFB1P16118 471 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 GJA1P17302 382 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 PSMD2Q13200 908 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 DPH6Q7L8W6 267 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 ITIH5Q86UX2 942 aa20.86■□□□□ 0.93
USP40-217ENST00000496298 WDR49Q8IV35 697 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms