RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ALDH1A2O94788 518 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CFIP05156 583 aa6.71□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 ENGP17813 658 aa6.71□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 PSMA5P28066 241 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 CYP4F8P98187 520 aa6.71□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 PDGFRLQ15198 375 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NPY5RQ15761 445 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PADI6Q6TGC4 694 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SYT12Q8IV01 421 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FBXL16Q8N461 479 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CEP120Q8N960 986 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TTC16Q8NEE8 873 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BEST2Q8NFU1 509 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BSNDQ8WZ55 320 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CD101Q93033 1021 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DRC1Q96MC2 740 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 AIFM3Q96NN9 605 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TCHPQ9BT92 498 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 LRRC3Q9BY71 257 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CNTN3Q9P232 1028 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 APC2O95996 2303 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MAST4O15021 2626 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS20P59510 1910 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 THADAQ6YHU6 1953 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 A0A087WWV3 80 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MTMR11A4FU01 709 aa6.7□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TNFRSF10BO14763 440 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 OPHN1O60890 802 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 OAZ2O95190 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 EDN1P05305 212 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MCF2P10911 925 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ARSAP15289 507 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CYP11B2P19099 503 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 BCKDHBP21953 392 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 27.8
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CBX1-205ENST00000495350 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GALK1P51570 392 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NR1H3Q13133 447 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 GPR17Q13304 367 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MYBPC2Q14324 1141 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 XKR4Q5GH76 650 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.7□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.7□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 KIFAP3Q92845 792 aa6.7□□□□□ -1.34
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CBX1-205ENST00000495350 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CHFRQ96EP1 664 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 CDT1Q9H211 546 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-205ENST00000495350 HPS4Q9NQG7 708 aa6.7□□□□□ -1.34
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