RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 CXorf38Q8TB03 319 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 TBC1D17Q9HA65 648 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ASAH2Q9NR71 780 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 GDE1Q9NZC3 331 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 AGAP1Q9UPQ3 857 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.43□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 TGFB1I1O43294 461 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 MOSPD3O75425 235 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 TMEM191BP0C7N4 346 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 FCARP24071 287 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PNPLA4P41247 253 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CLCN5P51795 746 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 EPHA5P54756 1037 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 KRT85P78386 507 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 BFSP1Q12934 665 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PLD1Q13393 1074 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CYP4A22Q5TCH4 519 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 TMC8Q8IU68 726 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SPATA32Q96LK8 384 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SIX4Q9UIU6 781 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ITGA11Q9UKX5 1188 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 L1RE1Q9UN81 338 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PTPRDP23468 1912 aa13.42□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 A0A1B0GVL5 298 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF197O14709 1029 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CLIC2O15247 247 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 KRT19P08727 400 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SLFN14P0C7P3 912 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 RFX1P22670 979 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CYP2J2P51589 502 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 EPHB3P54753 998 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM78AQ5JUQ0 283 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 TANGO2Q6ICL3 276 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 LEMD2Q8NC56 503 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRC3Q9BY71 257 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 INTS13Q9NVM9 706 aa13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 NCANO14594 1321 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF233A6NK53 670 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 H0Y858 1186 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 STK25O00506 426 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 KLRC4O43908 158 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ECI2O75521 394 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 MICAL2O94851 1124 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ALDH1A3P47895 512 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 NUBP1P53384 320 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 TEAD2Q15562 447 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 PAGE5Q96GU1 130 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZSWIM3Q96MP5 696 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 HPSEQ9Y251 543 aa13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SUCLG2-204ENST00000493112 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.4□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 A0A1W2PRU2 124 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 ATF6P18850 670 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 CMA1P23946 247 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 RBP5P82980 135 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 GRM2Q14416 872 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC142Q17RM4 750 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 MGAT5BQ3V5L5 792 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 OSTM1Q86WC4 334 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 RDH13Q8NBN7 331 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 ELSPBP1Q96BH3 223 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 ASB16Q96NS5 453 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 FOXQ1Q9C009 403 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.39□□□□□ -0.27
SUCLG2-204ENST00000493112 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms