RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488773.1

SFT2D1-205, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene SFT2D1, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-205ENST00000488773 AKAP5P24588 427 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 CCNE1P24864 410 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 GDI1P31150 447 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MPLP40238 635 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MLH1P40692 756 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 RAP1GAPP47736 663 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 AMPD3Q01432 767 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 CREMQ03060 361 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MCL1Q07820 350 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 EHHADHQ08426 723 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 PDE4CQ08493 712 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 GRIK3Q13003 919 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 LRRC32Q14392 662 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 GAS6Q14393 721 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 KYAT1Q16773 422 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 DYMQ7RTS9 669 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 GPR65Q8IYL9 337 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 PDILTQ8N807 584 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 GAB3Q8WWW8 586 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 IRF7Q92985 503 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 HVCN1Q96D96 273 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 SPATA32Q96LK8 384 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 ZFP42Q96MM3 310 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 TSPAN18Q96SJ8 248 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 TRIM9Q9C026 710 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 CDT1Q9H211 546 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 CHST7Q9NS84 486 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 SNTG2Q9NY99 539 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 GDE1Q9NZC3 331 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 FNIP2Q9P278 1114 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 USP25Q9UHP3 1055 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 KLK13Q9UKR3 277 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 MYH11P35749 1972 aa6.09□□□□□ -1.43
SFT2D1-205ENST00000488773 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 CLDN3O15551 220 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 FAM189A1O60320 539 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 TADA2AO75478 443 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 RECQL4O94761 1208 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 CAVIN2O95810 425 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 MYL1P05976 194 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 THP07101 528 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SLFN14P0C7P3 912 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 LIG1P18858 919 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 HOXC13P31276 330 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SCNN1GP51170 649 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 CREB5Q02930 508 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 TUSC3Q13454 348 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 ALCAMQ13740 583 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 ZBTB6Q15916 424 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 FUT10Q6P4F1 479 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 Q6ZS52 159 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SFR1Q86XK3 245 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 PROSER1Q86XN7 944 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 CEP57Q86XR8 500 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 DEFB124Q8NES8 71 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 DHX58Q96C10 678 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 ACAP3Q96P50 834 aa6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SFT2D1-205ENST00000488773 TCHPQ9BT92 498 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms