RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RPSA-208	ENST00000487876	OBSL1	O75147	1896 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	COL4A3	Q01955	1670 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	EXOC3	O60645	756 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TNNC2	P02585	160 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CEBPB	P17676	345 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PNPLA4	P41247	253 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	RBP5	P82980	135 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PNOC	Q13519	176 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TDG	Q13569	410 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PSMD6	Q15008	389 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	FGF14	Q92915	247 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DSE	Q9UL01	958 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PTPRD	P23468	1912 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PTPN2	P17706	415 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TNNI1	P19237	187 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SURF1	Q15526	300 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MAFF	Q9ULX9	164 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MOSPD3	O75425	235 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	NR3C1	P04150	777 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	GJA1	P17302	382 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PDXK	O00764	312 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	HUS1	O60921	280 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CFH	P08603	1231 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MYL4	P12829	197 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ATF6	P18850	670 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	DLG4	P78352	724 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	MYO1E	Q12965	1108 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	KCNB1	Q14721	858 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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