RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa17.19■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 DPP7Q9UHL4 492 aa17.19■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.19■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 COL4A3Q01955 1670 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 LAMTOR5O43504 91 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ADH1AP07327 375 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 NFICP08651 508 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 LILRA4P59901 499 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PSMD6Q15008 389 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 RTP2Q5QGT7 225 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 FAM171A1Q5VUB5 890 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 C9orf57Q5W0N0 161 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ANKS3Q6ZW76 656 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ATRIPQ8WXE1 791 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 RABGGTAQ92696 567 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.18■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 TEX28O15482 410 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 OAZ2O95190 189 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PPP1R2P41236 205 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 STARD6P59095 220 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 EDRF1Q3B7T1 1238 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CENPPQ6IPU0 288 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SLC8B1Q6J4K2 584 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CYP26C1Q6V0L0 522 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CBWD2Q8IUF1 395 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 WDR49Q8IV35 697 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SMARCE1Q969G3 411 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 INTS13Q9NVM9 706 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 DPP3Q9NY33 737 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 MTRRQ9UBK8 725 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ITGA11Q9UKX5 1188 aa17.17■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ARHGEF37A1IGU5 675 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CYP11A1P05108 521 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 TYMPP19971 482 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 TGM1P22735 817 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PNPLA4P41247 253 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 WNT7BP56706 349 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SPAG1Q07617 926 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CYP24A1Q07973 514 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 RAB33AQ14088 237 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PPM1JQ5JR12 505 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 LRRC52Q8N7C0 313 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 APPL2Q8NEU8 664 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SHDQ96IW2 340 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CLSTN3Q9BQT9 956 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 BCO2Q9BYV7 579 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 EPC1Q9H2F5 836 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 LMBRD1Q9NUN5 540 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 MAFFQ9ULX9 164 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PCDHB8Q9UN66 801 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 NUB1Q9Y5A7 615 aa17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 GOLGA8IPA6NC78 632 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 GOLGA8JA6NMD2 632 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 IKBKBO14920 756 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CLIC2O15247 247 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 LAMP2P13473 410 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 BRCC3P46736 316 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 AP3M2P53677 418 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 HTR4Q13639 388 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 C1orf127Q8N9H9 656 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 TRIML1Q8N9V2 468 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ZBTB44Q8NCP5 570 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SPATA18Q8TC71 538 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PARD3BQ8TEW8 1205 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 HASPINQ8TF76 798 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 FAM212AQ96EL1 285 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 GBP4Q96PP9 640 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 PARD6AQ9NPB6 346 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 NUMBLQ9Y6R0 609 aa17.15■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.14■□□□□ 0.34
C1orf61-217ENST00000486517 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 ANHXE9PGG2 379 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 EXOC3O60645 756 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 RFPL2O75678 378 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 NR3C1P04150 777 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 FAM163BP0C2L3 166 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 PRCPP42785 496 aa17.14■□□□□ 0.33
C1orf61-217ENST00000486517 MORC3Q14149 939 aa17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms