RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZNF560Q96MR9 790 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LRRC3Q9BY71 257 aa20.26■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 KRT19P08727 400 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PNPLA4P41247 253 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CUL4BQ13620 913 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 UNC13DQ70J99 1090 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TMC8Q8IU68 726 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LEMD2Q8NC56 503 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CXorf38Q8TB03 319 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ASB16Q96NS5 453 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 FOXQ1Q9C009 403 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.25■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SCN1AP35498 2009 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PRU2 124 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TGFB1I1O43294 461 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 STARD6P59095 220 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 EHHADHQ08426 723 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 GRM2Q14416 872 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SHDQ96IW2 340 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SIX4Q9UIU6 781 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PTPRJQ12913 1337 aa20.24■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 COL4A3Q01955 1670 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZNF233A6NK53 670 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CLIC2O15247 247 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LRRN2O75325 713 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 VIPR2P41587 438 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PFKPQ01813 784 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 BFSP1Q12934 665 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 RDH13Q8NBN7 331 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SMARCD2Q92925 531 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 INTS13Q9NVM9 706 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 L1RE1Q9UN81 338 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TSC2P49815 1807 aa20.23■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ATF6P18850 670 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CD72P21854 359 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 RBP5P82980 135 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ANGPT1Q15389 498 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PJA1Q8NG27 643 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PSMG2Q969U7 264 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ASB3Q9Y575 518 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.22■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 A0A1B0GVL5 298 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 HUS1O60921 280 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 GLULP15104 373 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 CYP2J2P51589 502 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 PRKCQQ04759 706 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 VITQ6UXI7 678 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 GAREM2Q75VX8 874 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms