RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 POLIQ9UNA4 740 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 TSC2P49815 1807 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-211ENST00000480301 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MTMR11A4FU01 709 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 BMP6P22004 513 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 NTHL1P78549 312 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 OSTM1Q86WC4 334 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 LRG1P02750 347 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DUSP4Q13115 394 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MORC3Q14149 939 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DPH6Q7L8W6 267 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SPATA18Q8TC71 538 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MYADMQ96S97 322 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 GABRDO14764 452 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 IKBKBO14920 756 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DCXO43602 365 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 VNN1O95497 513 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MYL6P60660 151 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TRPC3Q13507 836 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ACBD6Q9BR61 282 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 CEP72Q9P209 647 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PHACTR2O75167 634 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ALADP13716 330 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 FSHRP23945 695 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ATICP31939 592 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 LHX1P48742 406 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 VAMP7P51809 220 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TWF1Q12792 350 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 BIRC3Q13489 604 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ZACNQ401N2 412 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TSG101Q99816 390 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 YIPF1Q9Y548 306 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 BIN1O00499 593 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 CETN3O15182 167 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 HCRTO43612 131 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 RHOP08100 348 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PTPN2P17706 415 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 CDR1P51861 262 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MYL7Q01449 175 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ENPEPQ07075 957 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SMARCB1Q12824 385 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 CAMK4Q16566 473 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SV2AQ7L0J3 742 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ITFG1Q8TB96 612 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 PKMYT1Q99640 499 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.195e-8■□□□□ 10.5
ACTB-211ENST00000480301 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 FAM163BP0C2L3 166 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 KRT13P13646 458 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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