RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ELMOD1Q8N336 334 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 NETO1Q8TDF5 533 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 C8orf76Q96K31 380 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ASAH2Q9NR71 780 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 DNM3Q9UQ16 869 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 YIPF1Q9Y548 306 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.2□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PATJQ8NI35 1801 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 LACTBL1A8MY62 500 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP99D6REC4 459 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TM4SF5O14894 197 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 AXIN1O15169 862 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 EXTL3O43909 919 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CXCL8P10145 99 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 LRPAP1P30533 357 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TNFSF9P41273 254 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TNK2Q07912 1038 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 GPR17Q13304 367 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PPP2R5DQ14738 602 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PON2Q15165 354 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ST3GAL2Q16842 350 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CENPPQ6IPU0 288 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 LONP2Q86WA8 852 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 YAF2Q8IY57 180 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 POM121Q96HA1 1249 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PNMA5Q96PV4 448 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PLIN2Q99541 437 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 IER2Q9BTL4 223 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 GPR88Q9GZN0 384 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 MAFFQ9ULX9 164 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.19□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TTC26A0AVF1 554 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 MTMR11A4FU01 709 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 LRP3O75074 770 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TOM1L1O75674 476 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CTHP32929 405 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 MCL1Q07820 350 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 GPR158Q5T848 1215 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 LEMD2Q8NC56 503 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 E2F7Q96AV8 911 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CEP250Q9BV73 2442 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CLDN3O15551 220 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEF12O95522 483 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CLTAP09496 248 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 PLS3P13797 630 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 GUCY2CP25092 1073 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 10.1
CTPS1-208ENST00000479480 GABRR2P28476 465 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CNR2P34972 360 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 ALDH1A3P47895 512 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 TRAPPC10P48553 1259 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 EPHB3P54753 998 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CYP4F8P98187 520 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 STRN3Q13033 797 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 CCINQ13939 588 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC32Q14392 662 aa9.17□□□□□ -0.94
CTPS1-208ENST00000479480 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
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