RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC34A1Q06495 639 aa14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP1-206ENST00000469947 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP1-206ENST00000469947 AP1B1Q10567 949 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP1-206ENST00000469947 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP1-206ENST00000469947 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP1-206ENST00000469947 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP1-206ENST00000469947 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP1-206ENST00000469947 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP1-206ENST00000469947 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.24□□□□□ -0.13
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