RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2HP62256 183 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 MYL7Q01449 175 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPY1Q01534 308 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 SMARCB1Q12824 385 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 BIRC3Q13489 604 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPN21Q16825 1174 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 IQCEQ6IPM2 695 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 DPH6Q7L8W6 267 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 OR10T2Q8NGX3 314 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA20Q8TB22 786 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 LIMD1Q9UGP4 676 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 L1RE1Q9UN81 338 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 SORCS3Q9UPU3 1222 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR11A4FU01 709 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ALDH1A3P47895 512 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 LHX1P48742 406 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 CASP4P49662 377 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 NTHL1P78549 312 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TWF1Q12792 350 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 STIM1Q13586 685 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR3Q13615 1198 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TMC2Q8TDI7 906 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 EDAQ92838 391 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 MYADMQ96S97 322 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM209Q96SK2 561 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 TSG101Q99816 390 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 EPS15L1Q9UBC2 864 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 YIPF1Q9Y548 306 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 MYH10P35580 1976 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR37L1O60883 481 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CLSTN1O94985 981 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 RHOP08100 348 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT13P13646 458 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PCSK1P29120 753 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ATICP31939 592 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R2P41236 205 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PRCPP42785 496 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CLDN10P78369 228 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZXDAP98168 799 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP4Q13115 394 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAM9Q13443 819 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPPQ6IPU0 288 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM186BQ8IYM0 893 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 LEMD2Q8NC56 503 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF516Q92618 1163 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 MMS19Q96T76 1030 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ACBD6Q9BR61 282 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CORO1BQ9BR76 489 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRDP23468 1912 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIOO75962 3097 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF197O14709 1029 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 IKBKBO14920 756 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CETN3O15182 167 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 ASGR2P07307 311 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 LAMP2P13473 410 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 VAMP7P51809 220 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 EPHB3P54753 998 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 TNNC1P63316 161 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-205ENST00000466097 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms