RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 PHKG2P15735 406 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FDXRP22570 491 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PCSK1P29120 753 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CXCR5P32302 372 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CASP2P42575 452 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ERVK-21P61565 698 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CXADRP78310 365 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GALEQ14376 348 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 XRRA1Q6P2D8 792 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GJA10Q969M2 543 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 VOPP1Q96AW1 172 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 DMTF1Q9Y222 760 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 KAT6BQ8WYB5 2073 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MAST3O60307 1309 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC78A2IDD5 438 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ANP32CO43423 234 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PRSS23O95084 383 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GPANK1O95872 356 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CCND1P24385 295 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 HSD11B2P80365 405 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.511e-7■□□□□ 10.6
RABGGTB-204ENST00000461653 BIRC3Q13489 604 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GBX1Q14549 363 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 TOMM20Q15388 145 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC142Q17RM4 750 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC93Q567U6 631 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR16Q569H4 304 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.63□□□□□ -1.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 Q96MF0 132 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.63□□□□□ -1.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 RENBPP51606 427 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MTM1Q13496 603 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 CAGE1Q8TC20 777 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.62□□□□□ -1.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 K7ESF4 209 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 MASP2O00187 686 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 AGR2O95994 175 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 AMY1AP04745 511 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 CKBP12277 381 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 TERF1P54274 439 aa5.61□□□□□ -1.51
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RABGGTB-204ENST00000461653 LONRF1Q17RB8 773 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC17Q96AE7 1141 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-204ENST00000461653 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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