RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 KRT13P13646 458 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 AP3M2P53677 418 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 EPHB3P54753 998 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TNNC1P63316 161 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM209Q96SK2 561 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.02■■□□□ 1.12
SCAF8-204ENST00000461219 NOTCH4Q99466 2003 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PAPLNO95428 1278 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CASP4P49662 377 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ZXDAP98168 799 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 DUSP4Q13115 394 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 TAF12Q16514 161 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 EDAQ92838 391 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MYADMQ96S97 322 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 DMAC2Q9NW81 257 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 L1RE1Q9UN81 338 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 YIPF1Q9Y548 306 aa22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MTMR11A4FU01 709 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 RHOP08100 348 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PCSK1P29120 753 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 LHX1P48742 406 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 UBE2HP62256 183 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SMARCB1Q12824 385 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ADAM9Q13443 819 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 BORCS6Q96GS4 357 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ASAH2Q9NR71 780 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF197O14709 1029 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CDR1P51861 262 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 VEPH1Q14D04 833 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CENPPQ6IPU0 288 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA18Q8TC71 538 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ING5Q8WYH8 240 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SNX25Q9H3E2 840 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CDH7Q9ULB5 785 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MYH10P35580 1976 aa21.99■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CETN3O15182 167 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 GPR37L1O60883 481 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MYL4P12829 197 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 LAMP2P13473 410 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PRCPP42785 496 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 NFIL3Q16649 462 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ISM2Q6H9L7 571 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 DPH6Q7L8W6 267 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 LEMD2Q8NC56 503 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 CXorf38Q8TB03 319 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 TMC2Q8TDI7 906 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ACBD6Q9BR61 282 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 KCNK12Q9HB15 430 aa21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 PSMA7O14818 248 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MAPK13O15264 365 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ATICP31939 592 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 VAMP7P51809 220 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 MYL6P60660 151 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 TDGQ13569 410 aa21.97■■□□□ 1.11
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF699Q32M78 642 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms