RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 PTPN21Q16825 1174 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 MYADMQ96S97 322 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 YIPF1Q9Y548 306 aa22.29■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 PRCPP42785 496 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 AP3M2P53677 418 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 TWF1Q12792 350 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 TRPC3Q13507 836 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 MAPK13O15264 365 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 PHACTR2O75167 634 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ASGR2P07307 311 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 CLDN10P78369 228 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 DUSP4Q13115 394 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ADAM9Q13443 819 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 BIRC3Q13489 604 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 CENPPQ6IPU0 288 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ELMOD1Q8N336 334 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 SPATA18Q8TC71 538 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 TMC2Q8TDI7 906 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.27■■□□□ 1.16
VARS-218ENST00000459667 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 AKAP3O75969 853 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 RHOP08100 348 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PTPN2P17706 415 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 DLG4P78352 724 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MYL7Q01449 175 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TSPY1Q01534 308 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PLD1Q13393 1074 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.26■■□□□ 1.15
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VARS-218ENST00000459667 DPH6Q7L8W6 267 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 EDAQ92838 391 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 GBP4Q96PP9 640 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CORO1BQ9BR76 489 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 NOTCH4Q99466 2003 aa22.26■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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VARS-218ENST00000459667 MYL6P60660 151 aa22.25■■□□□ 1.15
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VARS-218ENST00000459667 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ISM2Q6H9L7 571 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 IQCEQ6IPM2 695 aa22.25■■□□□ 1.15
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VARS-218ENST00000459667 OSTM1Q86WC4 334 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ITFG1Q8TB96 612 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MMS19Q96T76 1030 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TSG101Q99816 390 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ACBD6Q9BR61 282 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CEP72Q9P209 647 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MYO10Q9HD67 2058 aa22.25■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 GABRDO14764 452 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CLSTN1O94985 981 aa22.24■■□□□ 1.15
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VARS-218ENST00000459667 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 LAMP2P13473 410 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 KRT13P13646 458 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ATICP31939 592 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ALDH1A3P47895 512 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 VAMP7P51809 220 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CDR1P51861 262 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 TNNC1P63316 161 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 MTMR3Q13615 1198 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 ADSSL1Q8N142 457 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
VARS-218ENST00000459667 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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