RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 ACCSQ96QU6 501 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 TMEM206Q9H813 350 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 CBX8Q9HC52 389 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 TBX20Q9UMR3 447 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 EXOC7Q9UPT5 735 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-208ENST00000438888 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 MCF2P10911 925 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 PTPN2P17706 415 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 MYL5Q02045 173 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 LRRC63Q05C16 580 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SPAG1Q07617 926 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 KCNA1Q09470 495 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 STRN3Q13033 797 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TANGO2Q6ICL3 276 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CENPPQ6IPU0 288 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 POTEHQ6S545 545 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SYCP3Q8IZU3 236 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 AOPEPQ8N6M6 819 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 RNF214Q8ND24 703 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ZNF461Q8TAF7 563 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 RMDN1Q96DB5 314 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TSG101Q99816 390 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 FBXL5Q9UKA1 691 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 INSL5Q9Y5Q6 135 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 DCHS1Q96JQ0 3298 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SMTNL1A8MU46 457 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 BECN2A8MW95 431 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 H7C4K7 107 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 IKBKBO14920 756 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SYN3O14994 580 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ECI2O75521 394 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SEC24AO95486 1093 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CPB1P15086 417 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 KCNE1P15382 129 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 PMS1P54277 932 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 IQCB1Q15051 598 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 XKR4Q5GH76 650 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TTI2Q6NXR4 508 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 FOXR2Q6PJQ5 311 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 LUZP1Q86V48 1076 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 BICD1Q96G01 975 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 MED15Q96RN5 788 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 RBSNQ9H1K0 784 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 GDE1Q9NZC3 331 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CNTN3Q9P232 1028 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 FRYLO94915 3013 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF37A1IGU5 675 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 PDXKO00764 312 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ABLIM1O14639 778 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ABLIM3O94929 683 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CXCL8P10145 99 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ATF2P15336 505 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 GJA1P17302 382 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 PROZP22891 400 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 CCR2P41597 374 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ADCY1Q08828 1119 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TWF1Q12792 350 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 EDRF1Q3B7T1 1238 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 FAM78AQ5JUQ0 283 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 PRSS36Q5K4E3 855 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 SPATA1Q5VX52 437 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ZNF280DQ6N043 979 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 TSSK4Q6SA08 328 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 RTL10Q7L3V2 364 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 ELMOD1Q8N336 334 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-208ENST00000438888 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms