RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427262.5

SEMA3E-202, Transcript of semaphorin 3E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SEMA3E, Length 2,414 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3E-202ENST00000427262 EPS15P42566 896 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 NR1H3Q13133 447 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PRKG1Q13976 671 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ARSHQ5FYA8 562 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RANBP9Q96S59 729 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PSD2Q9BQI7 771 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 HAUS8Q9BT25 410 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 SNX25Q9H3E2 840 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RAB26Q9ULW5 256 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 A0A1W2PRG0 241 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 H3BNX3 289 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RGS13O14921 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 SIN3BO75182 1162 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 KRT75O95678 551 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TTC4O95801 387 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CCDC159P0C7I6 412 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CETPP11597 493 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 KRT13P13646 458 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PRKCIP41743 596 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ALDH3B2P48448 385 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 NUBP1P53384 320 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 MAPK6Q16659 721 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TXNRD1Q16881 649 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RGS21Q2M5E4 152 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 USP43Q70EL4 1123 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 NLRP10Q86W26 655 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 C18orf8Q96DM3 657 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TCF12Q99081 682 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 AAASQ9NRG9 546 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CDH7Q9ULB5 785 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 SQORQ9Y6N5 450 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 B4E1Z4 1266 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CDK2AP1O14519 115 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 DNAJA2O60884 412 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CRYZL1O95825 349 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 INHBBP09529 407 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PDE6AP16499 860 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ETV3P41162 512 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TCIRG1Q13488 830 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TIGD2Q4W5G0 525 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CENPPQ6IPU0 288 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 OGFOD2Q6N063 350 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 RNF169Q8NCN4 708 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TNFRSF25Q93038 417 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 SHISA4Q96DD7 197 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 NENFQ9UMX5 172 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 DCCP43146 1447 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 KRBA1A5PL33 1030 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 B2RBV5 119 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 CENPBD1B2RD01 187 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 IDH3BO43837 385 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PRDX6P30041 224 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ZBTB16Q05516 673 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 PDE4DQ08499 809 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 TRIP10Q15642 601 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA3E-202ENST00000427262 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms