RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 KLRC1P26715 233 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CCNG1P51959 295 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RTP1P59025 263 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CDHR1Q96JP9 859 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NT5C1BQ96P26 610 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 BTBD9Q96Q07 612 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 C8orf4Q9NR00 106 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 C5orf60A6NFR6 353 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 KRT36O76013 467 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ATP2B4P23634 1241 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 HOXD12P35452 270 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ABL2P42684 1182 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZAP70P43403 619 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TAB1Q15750 504 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FOSL1P15407 271 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TMC4Q7Z404 712 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CCNJLQ8IV13 435 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FAM13CQ8NE31 585 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GJA10Q969M2 543 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 C18orf8Q96DM3 657 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FBP2O00757 339 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FAF2Q96CS3 445 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 IL12AP29459 219 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 EPS8Q12929 822 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PPP2R5DQ14738 602 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 HPS3Q969F9 1004 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TAMM41Q96BW9 452 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CNPY3Q9BT09 278 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TSPOAP1O95153 1857 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SPEF2Q9C093 1822 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 NT5C2P49902 561 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SEMA3DO95025 777 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FLT3P36888 993 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GSSP48637 474 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ACAP1Q15027 740 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP69Q49AA0 526 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINB9P50453 376 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF333Q96JL9 665 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 TLR10Q9BXR5 811 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZBED4O75132 1171 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ALCAMQ13740 583 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 MAPK11Q15759 364 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 CHI3L2Q15782 390 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SBNO1-202ENST00000420886 APOL6Q9BWW8 343 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms