RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 LHX5Q9H2C1 402 aa20.14■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.13■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.13■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.12■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.12■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.12■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 SGO2Q562F6 1265 aa20.09■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.814e-6■■□□□ 12.7
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USP39-202ENST00000409025 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 C3orf20Q8ND61 904 aa20.09■□□□□ 0.81
USP39-202ENST00000409025 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.09■□□□□ 0.81
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USP39-202ENST00000409025 NFU1Q9UMS0 254 aa20.09■□□□□ 0.81
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