RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 ERMNQ8TAM6 284 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.01■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 LNP1A1A4G5 178 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM8BA6NDV4 472 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C75A6NL08 312 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 RHOBTB1O94844 696 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 FGF19O95750 216 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ELF2Q15723 593 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 DAW1Q8N136 415 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 LPIN3Q9BQK8 851 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 SLC46A2Q9BY10 475 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 EBF3Q9H4W6 596 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 IL21Q9HBE4 155 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa21■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 LRPAP1P30533 357 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CDR1P51861 262 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 RING1Q06587 406 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 USP37Q86T82 979 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 NECAB1Q8N987 351 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 INVSQ9Y283 1065 aa20.99■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP13Q12802 2813 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 IGF2RP11717 2491 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 LARGE1O95461 756 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CEACAM1P13688 526 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 MUTP22033 750 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 GALK1P51570 392 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 MYBPC2Q14324 1141 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ITIH5Q86UX2 942 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 LHX6Q9UPM6 363 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.98■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 NUP205Q92621 2012 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 HIP1RO75146 1068 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 OR52Z1P0C646 297 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 GUCY2FP51841 1108 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF174Q15697 407 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB6Q15916 424 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CCL26Q9Y258 94 aa20.97■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 PATE3B3GLJ2 98 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A4O15374 487 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL8P10145 99 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ARSAP15289 507 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ATF6P18850 670 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CDC25CP30307 473 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 GBP1P32455 592 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 SYT13Q7L8C5 426 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 RIN3Q8TB24 985 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 KIF12Q96FN5 646 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXD12-201ENST00000404162 SOBPA7XYQ1 873 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 SFI1A8K8P3 1242 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 E9PMD0 336 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 PPEF2O14830 753 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 APBB3O95704 486 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 TYMPP19971 482 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 DRD1P21728 446 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK7Q13164 816 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 DMC1Q14565 340 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB124Q8NES8 71 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 GIPC2Q8TF65 315 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 EBF1Q9UH73 591 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.95■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 TTC26A0AVF1 554 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 JAK2O60674 1132 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 TOM1L1O75674 476 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 DGKEP52429 567 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 VEPH1Q14D04 833 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.94■□□□□ 0.94
HOXD12-201ENST00000404162 PMS2CLQ68D20 193 aa20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms