RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 PROZP22891 400 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFSF9P41273 254 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRM5P41594 1212 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAPK8P45983 427 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ST3GAL1Q11201 340 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLD1Q13393 1074 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT32Q14532 448 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CALCRLQ16602 461 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAPK6Q16659 721 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAB4Q2WGN9 574 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC10A6Q3KNW5 377 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BMP2KLQ5H9B9 411 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPGS2Q68CL5 300 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PMS2CLQ68D20 193 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 IQCEQ6IPM2 695 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPPQ6IPU0 288 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF280DQ6N043 979 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PADI6Q6TGC4 694 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTL10Q7L3V2 364 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 YAF2Q8IY57 180 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEPTORQ8TB45 409 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GIPC2Q8TF65 315 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RLN3Q8WXF3 142 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM84AQ96KN4 292 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC22A12Q96S37 553 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GKN1Q9NS71 199 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DOCK9Q9BZ29 2069 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTBD18B2RXH4 712 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0QZQ0 153 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HCRTO43612 131 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 JAK2O60674 1132 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDC45O75419 566 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CXCL8P10145 99 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNE1P15382 129 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP11B2P19099 503 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GJA4P35212 333 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTGER3P43115 390 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAMPTP43490 491 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 GALK1P51570 392 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEC13P55735 322 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAPK7Q13164 816 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RUNX3Q13761 415 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 DMC1Q14565 340 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBR1Q14596 966 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM92Q6UXU6 159 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RUFY3Q7L099 469 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNK18Q7Z418 384 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDZD3Q86UT5 571 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PROSER1Q86XN7 944 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NECAB1Q8N987 351 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSMG2Q969U7 264 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 UROC1Q96N76 676 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 FNBP1Q96RU3 617 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD93Q9NPY3 652 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMLHEQ9NVH6 421 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNTN3Q9P232 1028 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLXNA2O75051 1894 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 KNTC1P50748 2209 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms