RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 BACH1O14867 736 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CLN5O75503 358 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GSSP48637 474 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF165P49910 485 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 IYDQ6PHW0 289 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FNDC8Q8TC99 324 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 THAP11Q96EK4 314 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TM9SF2Q99805 663 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GLRX2Q9NS18 164 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 E9PMD0 336 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 EGFRP00533 1210 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CD4P01730 458 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FGRP09769 529 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SDSP20132 328 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CASP1P29466 404 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNC4Q03721 635 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRNEQ04844 493 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PHKG1Q16816 387 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ALS2CLQ60I27 953 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BEND4Q6ZU67 534 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9A6Q92581 669 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MARC2Q969Z3 335 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP6Q96JE9 813 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK19Q9BWU1 502 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 BBS2Q9BXC9 721 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CDH19Q9H159 772 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NDST4Q9H3R1 872 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MU76 341 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ETV1P50549 477 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 AMPD2Q01433 879 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NCAPHQ15003 741 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PON2Q15165 354 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ELMOD1Q8N336 334 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF169Q8NCN4 708 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPH1Q92598 858 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO40Q9UH90 709 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ITGB4P16144 1822 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXO3O43524 673 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PI15O43692 258 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 STX10O60499 249 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NIPSNAP2O75323 286 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNA14P01570 189 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 VAV1P15498 845 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC1A1P43005 524 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC24CP53992 1094 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RX3P56373 397 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DRP2Q13474 957 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPRE2Q15555 327 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TEAD4Q15561 434 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NPTX1Q15818 432 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PTGISQ16647 500 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52K2Q8NGK3 314 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 FAR2Q96K12 515 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP170P1Q96L14 293 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 AMACRQ9UHK6 382 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 UBXN8O00124 270 aa7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMD11O00231 422 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms