RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365172.1

SNORD49B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 49B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD49B, Length 72 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD49B-201ENST00000365172 MED13LQ71F56 2210 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 LCE6AA0A183 80 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 A0A1W2PPC1 479 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 WDR27A2RRH5 827 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TMEM88BA6NKF7 163 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM90A27PA6NNH2 459 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SMTNL1A8MU46 457 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TARM1B6A8C7 271 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PRRT4C9JH25 899 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ADM5C9JUS6 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF213O14771 459 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 NRP1O14786 923 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TREHO43280 583 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EDIL3O43854 480 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PEX1O43933 1283 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZG16O60844 167 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TULP3O75386 442 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ERN1O75460 977 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CRLF1O75462 422 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ABL1P00519 1130 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PIGRP01833 764 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 APOHP02749 345 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TP53P04637 393 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SCG5P05408 212 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ITGAVP06756 1048 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EPHX1P07099 455 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FGF2P09038 288 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 INAFM2P0DMQ5 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SRGNP10124 158 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CYP2D6P10635 497 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 RBP3P10745 1247 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 LCP1P13796 627 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MYF6P23409 242 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GRK2P25098 689 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MGAT1P26572 445 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PCSK6P29122 969 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GRK3P35626 688 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SREBF1P36956 1147 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 KIR2DL3P43628 341 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 GJA8P48165 433 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ST13P50502 369 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 VAV2P52735 878 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 DLX5P56178 289 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 LGALS4P56470 323 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CXADRP78310 365 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EGR4Q05215 589 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CLCQ05315 142 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FAM160A1Q05DH4 1040 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 LRMPQ12912 555 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SEMA5AQ13591 1074 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PRKG1Q13976 671 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 KRT72Q14CN4 511 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TCEAL1Q15170 157 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SF1Q15637 639 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CYP2A13Q16696 494 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 KIZQ2M2Z5 673 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF718Q3SXZ3 478 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 C14orf177Q52M58 125 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FIGNQ5HY92 759 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF484Q5JVG2 852 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ZNF618Q5T7W0 954 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 MEI1Q5TIA1 1274 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 Q5VSD8 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PMS2CLQ68D20 193 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ALG1LQ6GMV1 187 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 NADSYN1Q6IA69 706 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 SDE2Q6IQ49 451 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 CEP85Q6P2H3 762 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 PDXDC1Q6P996 788 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 VWA1Q6PCB0 445 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 FBXL19Q6PCT2 694 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 USP17L6PQ6QN14 398 aa-0.03□□□□□ -2.41
SNORD49B-201ENST00000365172 IGFL3Q6UXB1 125 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms