RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 NR2E1Q9Y466 385 aa29.01■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 DENND4AQ7Z401 1863 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 HUS1O60921 280 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MYL6P60660 151 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ADAM9Q13443 819 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 CAMK4Q16566 473 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 EDRF1Q3B7T1 1238 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 CENPPQ6IPU0 288 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MYADMQ96S97 322 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 YIPF1Q9Y548 306 aa29■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 VNN1O95497 513 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 POU2F2P09086 479 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM49P0CI25 452 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM49CP0CI26 452 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MYO1EQ12965 1108 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 SLC39A12Q504Y0 691 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 LIMS2Q7Z4I7 341 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRF2Q8IZF7 708 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TMC2Q8TDI7 906 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 XYLT2Q9H1B5 865 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TMLHEQ9NVH6 421 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 USTQ9Y2C2 406 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa28.99■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 XYLBO75191 536 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 SOAT2O75908 522 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 LRG1P02750 347 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 VAMP7P51809 220 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TWF1Q12792 350 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 DUSP4Q13115 394 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 BIRC3Q13489 604 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MORC3Q14149 939 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 FAM186BQ8IYM0 893 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 THEM5Q8N1Q8 247 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TOP6BLQ8N6T0 577 aa28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK13O15264 365 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 DCXO43602 365 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ASGR2P07307 311 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 RPL13P26373 211 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 RTL10Q7L3V2 364 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 CEP72Q9P209 647 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 LIMD1Q9UGP4 676 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 NME7Q9Y5B8 376 aa28.97■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 GABRDO14764 452 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 PHACTR2O75167 634 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 PPP3CAQ08209 521 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 TRPC3Q13507 836 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 SV2AQ7L0J3 742 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 ITFG1Q8TB96 612 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28.96■■■□□ 2.23
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 FSHRP23945 695 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 NCOA4Q13772 614 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SLC5A9Q2M3M2 681 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ZACNQ401N2 412 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL10Q6JEL2 608 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM86AQ8N2M4 240 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PKMYT1Q99640 499 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 SMOC2Q9H3U7 446 aa28.95■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 RHOP08100 348 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 LMO2P25791 158 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 AP3M2P53677 418 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 WDR72Q3MJ13 1102 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 POTEHQ6S545 545 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 HS6ST3Q8IZP7 471 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MMS19Q96T76 1030 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 C11orf16Q9NQ32 467 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 MAFFQ9ULX9 164 aa28.94■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 FAM86C2PA6NEL3 165 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CETN3O15182 167 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2C2O75185 946 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 STAU1O95793 577 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 CCNE1P24864 410 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 GCLMP48507 274 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 ING5Q8WYH8 240 aa28.93■■■□□ 2.22
TPGS1-201ENST00000359315 TSG101Q99816 390 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms