RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357164.3

GM2A-201, Transcript of GM2 ganglioside activator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GM2A, Length 3,896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2A-201ENST00000357164 NADK2Q4G0N4 442 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SUSD4Q5VX71 490 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DHDDSQ86SQ9 333 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 LRRC6Q86X45 466 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 FAM71AQ8IYT1 594 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 NME8Q8N427 588 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 GLIS1Q8NBF1 620 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 EPS8L1Q8TE68 723 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 NPHS2Q9NP85 383 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SERPINA10Q9UK55 444 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CDH7Q9ULB5 785 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DENND3A2RUS2 1198 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 FBXO21O94952 628 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 GYS1P13807 737 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CHN2P52757 468 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 GPC5P78333 572 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 FMO1Q01740 532 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 P3H1Q32P28 736 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SFR1Q86XK3 245 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DYDC1Q8WWB3 177 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 GJA10Q969M2 543 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CEP95Q96GE4 821 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 REEP2Q9BRK0 252 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DMTF1Q9Y222 760 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 FKBP6O75344 327 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SPAG7O75391 227 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SLITRK3O94933 977 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 HOXD12P35452 270 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 EPS15P42566 896 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 UBL4BQ8N7F7 174 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DTX3LQ8TDB6 740 aa9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 MGAMO43451 1857 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 MAFGO15525 162 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ADAM23O75077 832 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ADRA1DP25100 572 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 GNA11P29992 359 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 MAGEA4P43358 317 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ARL4CP56559 192 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 TFAP4Q01664 338 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 AHI1Q8N157 1196 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ALLCQ8N6M5 410 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 NEURL2Q9BR09 285 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ACP6Q9NPH0 428 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 MKS1Q9NXB0 559 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 VAV3Q9UKW4 847 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 KLRF2D3W0D1 207 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 TGFBIQ15582 683 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 DOK1Q99704 481 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CPVLQ9H3G5 476 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 C6orf50Q9HD87 102 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 TMEM247A6NEH6 219 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 CLDN3O15551 220 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 HAUS5O94927 633 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 USP17L8P0C7I0 530 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 ARFIP2P53365 341 aa8.99□□□□□ -0.97
GM2A-201ENST00000357164 SESN3P58005 492 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms