RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PJA2O43164 708 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF12P17014 697 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ETFBP38117 255 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 CRKP46108 304 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 RAD23BP54727 409 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 SBK1Q52WX2 424 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 KRT74Q7RTS7 529 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 STAMQ92783 540 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 TBK1Q9UHD2 729 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 NMT2O60551 498 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 PRDX6P30041 224 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 ADCK1Q86TW2 530 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 H7C0C1 242 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 USP17L19D6RCP7 530 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L20D6RJB6 530 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF711Q9Y462 761 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 CLRN2A0PK11 232 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRD-201ENST00000355233 IDH3BO43837 385 aa5.13□□□□□ -1.59
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