RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329117.9

BCAN-201, Transcript of brevican, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCAN, Length 3,466 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAN-201ENST00000329117 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 JDP2Q8WYK2 163 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 IWS1Q96ST2 819 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 MIPEPQ99797 713 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 AMNQ9BXJ7 453 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 LZTS1Q9Y250 596 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 MTMR2Q13614 643 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TTC7BQ86TV6 843 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 NSL1Q96IY1 281 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 THTPAQ9BU02 230 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 BCORQ6W2J9 1755 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CACNA1SQ13698 1873 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TMEM247A6NEH6 219 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PSMG1O95456 288 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 NEK3P51956 506 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CAV1Q03135 178 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ACVR2BQ13705 512 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 BBS9Q3SYG4 887 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SLIT2O94813 1529 aa14.94□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 USP1O94782 785 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TJP3O95049 919 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 MAN1A1P33908 653 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 OXCT1P55809 520 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 BTKQ06187 659 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 MAPK6Q16659 721 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PALM2Q8IXS6 379 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TEKT1Q969V4 418 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GDF11O95390 407 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CYP11B1P15538 503 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SSTR1P30872 391 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CCNG1P51959 295 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PDK4Q16654 411 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 BBOF1Q8ND07 529 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 C10orf82Q8WW14 230 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GINM1Q9NU53 330 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TAF1P21675 1872 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 FSCN2O14926 492 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 OR6B1O95007 311 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ZWINTO95229 277 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PTK6Q13882 451 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 NRG4Q8WWG1 115 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SYNCQ9H7C4 482 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.93□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TMEM221A6NGB7 291 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GSC2O15499 205 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 IRX4P78413 519 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 FMO1Q01740 532 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 NR1H3Q13133 447 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 ACAP1Q15027 740 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CYP1B1Q16678 543 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 FAM20AQ96MK3 541 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 NT5C1BQ96P26 610 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 SNED1Q8TER0 1413 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.92□□□□□ -0.02
BCAN-201ENST00000329117 MEIS2O14770 477 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms