RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SDCBP2Q9H190 292 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 POLIQ9UNA4 740 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TET1Q8NFU7 2136 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ATP8B3O60423 1300 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ZBBXA8MT70 800 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CYB561D2O14569 222 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SYN3O14994 580 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGAP6O43182 974 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 B3GAT3O94766 335 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 UPP2O95045 317 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KIF4AO95239 1232 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LCA5LO95447 670 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 BMP8BP34820 402 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 OR1G1P47890 313 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SLC11A1P49279 550 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 BCAR1P56945 870 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CCZ1BP86790 482 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PTK2Q05397 1052 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GPR65Q8IYL9 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 WHAMMQ8TF30 809 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GDF15Q99988 308 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 AAASQ9NRG9 546 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 L1RE1Q9UN81 338 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TADA2AO75478 443 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 WEE2P0C1S8 567 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CYP11B1P15538 503 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RAD23BP54727 409 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 STILQ15468 1287 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 METTL23Q86XA0 190 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FIBCD1Q8N539 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF558Q96NG5 402 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MMS19Q96T76 1030 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 YME1L1Q96TA2 773 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MARCH5Q9NX47 278 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PTPRSQ13332 1948 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TTC36A6NLP5 189 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CYP26A1O43174 497 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 OAZ2O95190 189 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00271P0C7V0 271 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 VDRP11473 427 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 FGFR3P22607 806 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PPM1AP35813 382 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PDE6CP51160 858 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CDH8P55286 799 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 CDR2Q01850 454 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 TMEM270Q6UE05 265 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 VPS36Q86VN1 386 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-202ENST00000317118 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.28□□□□□ -1.4
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