RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 NME8Q8N427 588 aa22.73■■□□□ 1.23
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SOX17-201ENST00000297316 CD19P15391 556 aa22.67■■□□□ 1.22
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SOX17-201ENST00000297316 ATICP31939 592 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 CNTN3Q9P232 1028 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.66■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 RPS6KA5O75582 802 aa22.66■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 ECHS1P30084 290 aa22.66■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 THPOP40225 353 aa22.66■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.66■■□□□ 1.22
SOX17-201ENST00000297316 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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